Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms