Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF1Q15361 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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