Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRKD1Q15139 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRKD1Q15139 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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