Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERV3-1Q14264 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms