Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE1CQ14123 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE1CQ14123 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms