Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CKAP5Q14008 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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