Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RASGRF1Q13972 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF1Q13972 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms