Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RUNX2Q13950 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX2Q13950 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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