Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUL4BQ13620 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL4BQ13620 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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