Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TMED1Q13445 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TMED1Q13445 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TMED1Q13445 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED1Q13445 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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