Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SF3B2Q13435 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3B2Q13435 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms