Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM28Q13263 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM28Q13263 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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