Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF6Q13247 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms