Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPA4Q13156 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPA4Q13156 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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