Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHAF1AQ13111 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHAF1AQ13111 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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