Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRN3Q13033 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRN3Q13033 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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