Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIAQ12857 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms