Protein–RNA interactions for Protein: Q12400

TRM10, tRNA (guanine(9)-N1)-methyltransferase, yeastyeast

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10Q12400 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM10Q12400 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0.67□□□□□ -2.3
TRM10Q12400 YDL073WYDL073W 2955 nt0.66□□□□□ -2.3
TRM10Q12400 PMP1YCR024C-A 123 nt0.65□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YMR321CYMR321C 318 nt0.65□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 PAA1YDR071C 576 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YFL032WYFL032W 321 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YIL032CYIL032C 357 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 VIK1YPL253C 1944 nt0.64□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 HTL1YCR020W-B 237 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 RPS27BYHR021C 249 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 ASE1YOR058C 2658 nt0.63□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 NPR2YEL062W 1848 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YOR218CYOR218C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 CHS6YJL099W 2241 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YDR413CYDR413C 576 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 ATP6Q0085 780 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YFL063WYFL063W 456 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YGL149WYGL149W 306 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 RPL26BYGR034W 384 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 PAM16YJL104W 450 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 CSE2YNR010W 450 nt0.6□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YKL118WYKL118W 312 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.59□□□□□ -2.31
TRM10Q12400 YML002WYML002W 2214 nt0.58□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 LTE1YAL024C 4308 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YER097WYER097W 330 nt0.56□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 UBP3YER151C 2739 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.55□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YKL136WYKL136W 399 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 snR190snR190 190 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 MYO1YHR023W 5787 nt0.54□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 COX5BYIL111W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 YNL028WYNL028W 318 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 STE5YDR103W 2754 nt0.53□□□□□ -2.32
TRM10Q12400 FYV10YIL097W 1551 nt0.53□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YOR015WYOR015W 360 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 SEC8YPR055W 3198 nt0.52□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 PRP16YKR086W 3216 nt0.51□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.51□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 COY1YKL179C 2040 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 RPL39YJL189W 156 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 PRP5YBR237W 2550 nt0.5□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 RAD61YDR014W 1944 nt0.49□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.49□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YLR282CYLR282C 342 nt0.48□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.47□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.47□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.47□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 YPR092WYPR092W 306 nt0.47□□□□□ -2.33
TRM10Q12400 OST4YDL232W 111 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.46□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 ULI1YFR026C 510 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YGR069WYGR069W 336 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 PRP42YDR235W 1635 nt0.45□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YOR345CYOR345C 351 nt0.44□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 PET111YMR257C 2403 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 snR74snR74 88 nt0.43□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 HAL9YOL089C 3093 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YGL052WYGL052W 306 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 PAU12YGR294W 363 nt0.42□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.41□□□□□ -2.34
TRM10Q12400 SBH1YER087C-B 249 nt0.4□□□□□ -2.35
TRM10Q12400 BLI1YKL061W 342 nt0.4□□□□□ -2.35
TRM10Q12400 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.4□□□□□ -2.35
TRM10Q12400 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM10Q12400 RPS30BYOR182C 192 nt0.39□□□□□ -2.35
TRM10Q12400 YMR160WYMR160W 2451 nt0.38□□□□□ -2.35
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