Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 SDH7YDR511W 402 nt-0.92□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.92□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.93□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YPL182CYPL182C 384 nt-0.93□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YCR001WYCR001W 315 nt-0.94□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 RPF1YHR088W 888 nt-0.94□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 snR9snR9 187 nt-0.95□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YGR115CYGR115C 780 nt-0.95□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 SCEIQ0160 708 nt-0.95□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.95□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 POP7YBR167C 423 nt-0.95□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 BER1YLR412W 825 nt-0.96□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.96□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 YMR254CYMR254C 309 nt-0.97□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 SGF11YPL047W 300 nt-0.97□□□□□ -2.56
RTR2Q12378 COG6YNL041C 2520 nt-0.97□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YGL230CYGL230C 444 nt-0.99□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YGR025WYGR025W 303 nt-0.99□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YNR077CYNR077C 255 nt-0.99□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YPR092WYPR092W 306 nt-0.99□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 TAR1YLR154W-C 375 nt-1□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YPT6YLR262C 648 nt-1□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-1.01□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 MRPS8YMR158W 468 nt-1.02□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 PCF11YDR228C 1881 nt-1.03□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-1.03□□□□□ -2.57
RTR2Q12378 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.04□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YLR287CYLR287C 1068 nt-1.04□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 EST1YLR233C 2100 nt-1.04□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 MND1YGL183C 660 nt-1.05□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YJL120WYJL120W 324 nt-1.05□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YBR099CYBR099C 384 nt-1.05□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.06□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 GRX5YPL059W 453 nt-1.06□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YNL058CYNL058C 951 nt-1.07□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.08□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YHL041WYHL041W 450 nt-1.09□□□□□ -2.58
RTR2Q12378 YLR041WYLR041W 321 nt-1.11□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YLR282CYLR282C 342 nt-1.11□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.11□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 MATALPHA2YCR039C 633 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 HMRA2YCR096C 360 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YHR138CYHR138C 345 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 ZEO1YOL109W 342 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 TSC3YBR058C-A 243 nt-1.12□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.13□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YKL044WYKL044W 321 nt-1.13□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-1.14□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YJR087WYJR087W 351 nt-1.14□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 FYV7YLR068W 456 nt-1.15□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 RPS25BYLR333C 327 nt-1.15□□□□□ -2.59
RTR2Q12378 YIL029CYIL029C 429 nt-1.16□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 BLI1YKL061W 342 nt-1.16□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YER079WYER079W 633 nt-1.17□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YDL011CYDL011C 324 nt-1.18□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.18□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YCR100CYCR100C 951 nt-1.19□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 SNU13YEL026W 381 nt-1.19□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-1.19□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YPL229WYPL229W 621 nt-1.21□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YLR334CYLR334C 381 nt-1.22□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YOR015WYOR015W 360 nt-1.22□□□□□ -2.6
RTR2Q12378 YDL016CYDL016C 303 nt-1.25□□□□□ -2.61
RTR2Q12378 YBL071CYBL071C 309 nt-1.26□□□□□ -2.61
RTR2Q12378 YNL303WYNL303W 348 nt-1.26□□□□□ -2.61
RTR2Q12378 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.28□□□□□ -2.61
RTR2Q12378 YDR366CYDR366C 399 nt-1.3□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YDR426CYDR426C 378 nt-1.3□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.3□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.31□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YPL068CYPL068C 882 nt-1.31□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.32□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 AGA2YGL032C 264 nt-1.33□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.33□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 YKL083WYKL083W 615 nt-1.33□□□□□ -2.62
RTR2Q12378 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.35□□□□□ -2.63
RTR2Q12378 YJL182CYJL182C 318 nt-1.35□□□□□ -2.63
RTR2Q12378 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.39□□□□□ -2.63
RTR2Q12378 YLR269CYLR269C 351 nt-1.39□□□□□ -2.63
RTR2Q12378 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.39□□□□□ -2.63
RTR2Q12378 snR49snR49 165 nt-1.4□□□□□ -2.63
RTR2Q12378 YHR130CYHR130C 336 nt-1.44□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.45□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.45□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.45□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.45□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 YGL182CYGL182C 324 nt-1.46□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.46□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.47□□□□□ -2.64
RTR2Q12378 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.48□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 YAR029WYAR029W 225 nt-1.48□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 SKI7YOR076C 2244 nt-1.48□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.49□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 AIM29YKR074W 468 nt-1.5□□□□□ -2.65
RTR2Q12378 YLR456WYLR456W 615 nt-1.5□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms