Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP3CAQ08209 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPP3CAQ08209 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms