Protein–RNA interactions for Protein: Q08108

PLB3, Lysophospholipase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PLB3Q08108 CUL3YGR003W 2235 nt0.79□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 HTL1YCR020W-B 237 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 GPG1YGL121C 381 nt0.78□□□□□ -2.28
PLB3Q08108 RAD61YDR014W 1944 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 PAN2YGL094C 3348 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YER181CYER181C 324 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 ALG13YGL047W 609 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YHL042WYHL042W 453 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 ECM12YHR021W-A 456 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YBR206WYBR206W 324 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YLL007CYLL007C 1998 nt0.77□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 SPO21YOL091W 1830 nt0.76□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 snR65snR65 100 nt0.76□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YGL041CYGL041C 204 nt0.76□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.76□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 WAR1YML076C 2835 nt0.76□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 VIK1YPL253C 1944 nt0.76□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 COG8YML071C 1824 nt0.75□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YIR044CYIR044C 186 nt0.75□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YMR160WYMR160W 2451 nt0.75□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YCR022CYCR022C 345 nt0.74□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YDR521WYDR521W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 RPL39YJL189W 156 nt0.74□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YBR064WYBR064W 429 nt0.74□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 snR74snR74 88 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 QCR9YGR183C 201 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 RPS25BYLR333C 327 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 CMC4YMR194C-B 222 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 CSE2YNR010W 450 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YOR282WYOR282W 321 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 SGF11YPL047W 300 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 PTP2YOR208W 2253 nt0.73□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.72□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 YJL120WYJL120W 324 nt0.72□□□□□ -2.29
PLB3Q08108 snR80snR80 171 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YDL196WYDL196W 330 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YMR321CYMR321C 318 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 SEC1YDR164C 2175 nt0.71□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 MCM10YIL150C 1716 nt0.7□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 HMRA2YCR096C 360 nt0.7□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 ISD11YER048W-A 285 nt0.69□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YGL052WYGL052W 306 nt0.69□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 RPS27BYHR021C 249 nt0.69□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.68□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.68□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.68□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YNL028WYNL028W 318 nt0.68□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 RKR1YMR247C 4689 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 NPR2YEL062W 1848 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 OLI1Q0130 231 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 IES4YOR189W 351 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YOR218CYOR218C 420 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YPR092WYPR092W 306 nt0.67□□□□□ -2.3
PLB3Q08108 YDR366CYDR366C 399 nt0.65□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.65□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YNL211CYNL211C 261 nt0.65□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.63□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 snR8snR8 190 nt0.63□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.63□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.63□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 snR49snR49 165 nt0.63□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 ABF2YMR072W 552 nt0.62□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YOL014WYOL014W 375 nt0.62□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YOR302WYOR302W 78 nt0.62□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YOR345CYOR345C 351 nt0.62□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.62□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 BFR2YDR299W 1605 nt0.62□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.61□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 NOP9YJL010C 2001 nt0.6□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.6□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.6□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.6□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 YPL044CYPL044C 549 nt0.6□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 ASE1YOR058C 2658 nt0.59□□□□□ -2.31
PLB3Q08108 snR55snR55 98 nt0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.8 ms