Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTN3Q08043 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTN3Q08043 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms