Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXCL9Q07325 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXCL9Q07325 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms