Protein–RNA interactions for Protein: Q06011

ECM19, Protein ECM19, yeastyeast

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM19Q06011 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.69□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.69□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 ROM2YLR371W 4071 nt0.69□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 NST1YNL091W 3723 nt0.68□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 SCC2YDR180W 4482 nt0.68□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 RPL26BYGR034W 384 nt0.68□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 YNL028WYNL028W 318 nt0.68□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 RKR1YMR247C 4689 nt0.68□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 Q0142Q0142 177 nt0.67□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 PMP1YCR024C-A 123 nt0.66□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.66□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.66□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.66□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 YPR117WYPR117W 7470 nt0.65□□□□□ -2.3
ECM19Q06011 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.65□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.65□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.65□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 RAD61YDR014W 1944 nt0.65□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 SIP4YJL089W 2490 nt0.64□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 NPR2YEL062W 1848 nt0.64□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 REV3YPL167C 4515 nt0.63□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.63□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YGR069WYGR069W 336 nt0.62□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.62□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.62□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 BUD3YCL014W 4911 nt0.61□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 SAC3YDR159W 3906 nt0.6□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.6□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.6□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YOR015WYOR015W 360 nt0.6□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 SEC1YDR164C 2175 nt0.59□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 DOP1YDR141C 5097 nt0.59□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.59□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.59□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.59□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YPR092WYPR092W 306 nt0.59□□□□□ -2.31
ECM19Q06011 YML002WYML002W 2214 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 SEC8YPR055W 3198 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 PRP16YKR086W 3216 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 snR190snR190 190 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 CHS6YJL099W 2241 nt0.58□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 snR65snR65 100 nt0.57□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YGL052WYGL052W 306 nt0.57□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.57□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YNL146WYNL146W 303 nt0.57□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 IML1YJR138W 4755 nt0.57□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 ASE1YOR058C 2658 nt0.56□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.56□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 PAU24YBR301W 363 nt0.56□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 COY1YKL179C 2040 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 COX5BYIL111W 456 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.55□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YLR282CYLR282C 342 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.54□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 snR74snR74 88 nt0.53□□□□□ -2.32
ECM19Q06011 TTI1YKL033W 3117 nt0.53□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 FYV10YIL097W 1551 nt0.53□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.52□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YDL073WYDL073W 2955 nt0.52□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 UBP3YER151C 2739 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 BLI1YKL061W 342 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.51□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.5□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.49□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 PRP5YBR237W 2550 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 OST4YDL232W 111 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 ULI1YFR026C 510 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 RPS30BYOR182C 192 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 PRP42YDR235W 1635 nt0.48□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.47□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 PET111YMR257C 2403 nt0.47□□□□□ -2.33
ECM19Q06011 snR49snR49 165 nt0.46□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 snR55snR55 98 nt0.45□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 BEM3YPL115C 3387 nt0.45□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YCR022CYCR022C 345 nt0.44□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.44□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 LTE1YAL024C 4308 nt0.44□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 COX12YLR038C 252 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YOR345CYOR345C 351 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.43□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.42□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.42□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YKU70YMR284W 1809 nt0.41□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 HAL9YOL089C 3093 nt0.41□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YER181CYER181C 324 nt0.41□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 PAU12YGR294W 363 nt0.41□□□□□ -2.34
ECM19Q06011 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.7 ms