Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTDSPL2Q05D32 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms