Protein–RNA interactions for Protein: Q03981

CSN9, COP9 signalosome complex subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSN9Q03981 YJR087WYJR087W 351 nt-0.7□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 RPM2YML091C 3609 nt-0.7□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.71□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.72□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 RPF1YHR088W 888 nt-0.72□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.72□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.72□□□□□ -2.52
CSN9Q03981 DIE2YGR227W 1578 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 SGF11YPL047W 300 nt-0.73□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 YIL029CYIL029C 429 nt-0.74□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 BER1YLR412W 825 nt-0.74□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 YKL044WYKL044W 321 nt-0.75□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 YNL319WYNL319W 441 nt-0.75□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 TSC3YBR058C-A 243 nt-0.76□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 YNL058CYNL058C 951 nt-0.78□□□□□ -2.53
CSN9Q03981 YHL041WYHL041W 450 nt-0.8□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 YPR092WYPR092W 306 nt-0.8□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.81□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.82□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.82□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.82□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 snR33snR33 183 nt-0.83□□□□□ -2.54
CSN9Q03981 YDL016CYDL016C 303 nt-0.85□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 HMRA2YCR096C 360 nt-0.86□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 snR161snR161 161 nt-0.86□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 PCF11YDR228C 1881 nt-0.86□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 GLG1YKR058W 1851 nt-0.86□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 YDL011CYDL011C 324 nt-0.87□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 YCR100CYCR100C 951 nt-0.89□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 MRPS8YMR158W 468 nt-0.89□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 YPL229WYPL229W 621 nt-0.89□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 YBR099CYBR099C 384 nt-0.9□□□□□ -2.55
CSN9Q03981 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.91□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YLR282CYLR282C 342 nt-0.91□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 ZEO1YOL109W 342 nt-0.91□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 EST1YLR233C 2100 nt-0.92□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 FYV7YLR068W 456 nt-0.93□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YBL071CYBL071C 309 nt-0.93□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.93□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YHR138CYHR138C 345 nt-0.94□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt-0.94□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.95□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.95□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 snR36snR36 182 nt-0.95□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.96□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 SNU13YEL026W 381 nt-0.97□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 BLI1YKL061W 342 nt-0.97□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YAL066WYAL066W 309 nt-0.97□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YNL303WYNL303W 348 nt-0.97□□□□□ -2.56
CSN9Q03981 YKL083WYKL083W 615 nt-0.98□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YML007C-AYML007C-A 111 nt-0.98□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YDR426CYDR426C 378 nt-0.99□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YLR041WYLR041W 321 nt-0.99□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-0.99□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 RPS25BYLR333C 327 nt-1□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YLR334CYLR334C 381 nt-1□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-1.01□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YLR269CYLR269C 351 nt-1.01□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YPL068CYPL068C 882 nt-1.01□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 COG6YNL041C 2520 nt-1.01□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YJL120WYJL120W 324 nt-1.03□□□□□ -2.57
CSN9Q03981 YDR366CYDR366C 399 nt-1.05□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.05□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.06□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.07□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.07□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 GRX5YPL059W 453 nt-1.07□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.08□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.08□□□□□ -2.58
CSN9Q03981 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.11□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.12□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.12□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-1.13□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-1.14□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 AGA2YGL032C 264 nt-1.14□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 YAR047CYAR047C 321 nt-1.14□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 GPI15YNL038W 690 nt-1.15□□□□□ -2.59
CSN9Q03981 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-1.16□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.16□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 MPC1YGL080W 393 nt-1.17□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.17□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.18□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YER079WYER079W 633 nt-1.19□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-1.19□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YFL012WYFL012W 447 nt-1.2□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 YLR456WYLR456W 615 nt-1.2□□□□□ -2.6
CSN9Q03981 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.23□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 YHR125WYHR125W 306 nt-1.23□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 YHR130CYHR130C 336 nt-1.24□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.25□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.25□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 AIM29YKR074W 468 nt-1.25□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 TAH1YCR060W 336 nt-1.26□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 YAR029WYAR029W 225 nt-1.26□□□□□ -2.61
CSN9Q03981 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-1.29□□□□□ -2.62
CSN9Q03981 CBS1YDL069C 690 nt-1.3□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms