Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAV1Q03135 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAV1Q03135 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms