Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPIBQ01892 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms