Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN7AQ01118 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN7AQ01118 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms