Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1BQ01064 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms