Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2BQ00403 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms