Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTRA4P83105 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms