Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPS9P82933 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPS9P82933 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms