Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL11P62913 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL11P62913 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL11P62913 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL11P62913 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL11P62913 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL11P62913 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL11P62913 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL11P62913 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL11P62913 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms