Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS29P62273 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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