Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVS71-1P61550 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVS71-1P61550 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms