Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK1P57059 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK1P57059 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK1P57059 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK1P57059 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIK1P57059 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIK1P57059 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIK1P57059 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIK1P57059 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIK1P57059 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIK1P57059 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIK1P57059 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SIK1P57059 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK1P57059 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK1P57059 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK1P57059 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK1P57059 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SIK1P57059 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms