Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

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Length 1,592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 YJL086CYJL086C 369 nt-2.42□□□□□ -2.8
ATG2P53855 SPC24YMR117C 642 nt-2.42□□□□□ -2.8
ATG2P53855 RUF20RUF20 443 nt-2.43□□□□□ -2.8
ATG2P53855 BER1YLR412W 825 nt-2.44□□□□□ -2.8
ATG2P53855 YPR092WYPR092W 306 nt-2.44□□□□□ -2.8
ATG2P53855 YDR290WYDR290W 330 nt-2.45□□□□□ -2.8
ATG2P53855 snR189snR189 189 nt-2.45□□□□□ -2.8
ATG2P53855 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-2.45□□□□□ -2.8
ATG2P53855 snR5snR5 204 nt-2.47□□□□□ -2.8
ATG2P53855 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-2.47□□□□□ -2.8
ATG2P53855 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-2.49□□□□□ -2.81
ATG2P53855 PMP2YEL017C-A 132 nt-2.49□□□□□ -2.81
ATG2P53855 COX7YMR256C 183 nt-2.5□□□□□ -2.81
ATG2P53855 YOR366WYOR366W 354 nt-2.5□□□□□ -2.81
ATG2P53855 YPL068CYPL068C 882 nt-2.5□□□□□ -2.81
ATG2P53855 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-2.51□□□□□ -2.81
ATG2P53855 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-2.53□□□□□ -2.81
ATG2P53855 SCEIQ0160 708 nt-2.53□□□□□ -2.82
ATG2P53855 CUP1-1YHR053C 186 nt-2.54□□□□□ -2.82
ATG2P53855 CUP1-2YHR055C 186 nt-2.54□□□□□ -2.82
ATG2P53855 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-2.54□□□□□ -2.82
ATG2P53855 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-2.54□□□□□ -2.82
ATG2P53855 PET20YPL159C 762 nt-2.55□□□□□ -2.82
ATG2P53855 snR24snR24 89 nt-2.55□□□□□ -2.82
ATG2P53855 YOR170WYOR170W 306 nt-2.56□□□□□ -2.82
ATG2P53855 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-2.57□□□□□ -2.82
ATG2P53855 YER135CYER135C 393 nt-2.58□□□□□ -2.82
ATG2P53855 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-2.58□□□□□ -2.82
ATG2P53855 RPL22BYFL034C-A 369 nt-2.6□□□□□ -2.83
ATG2P53855 THG1YGR024C 714 nt-2.61□□□□□ -2.83
ATG2P53855 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-2.61□□□□□ -2.83
ATG2P53855 YDR543CYDR543C 300 nt-2.62□□□□□ -2.83
ATG2P53855 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-2.62□□□□□ -2.83
ATG2P53855 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-2.64□□□□□ -2.83
ATG2P53855 IRC16YPR038W 360 nt-2.64□□□□□ -2.83
ATG2P53855 snR72snR72 98 nt-2.65□□□□□ -2.83
ATG2P53855 YGL015CYGL015C 393 nt-2.65□□□□□ -2.83
ATG2P53855 BNS1YGR230W 414 nt-2.65□□□□□ -2.83
ATG2P53855 DFG10YIL049W 762 nt-2.65□□□□□ -2.83
ATG2P53855 SGF11YPL047W 300 nt-2.65□□□□□ -2.83
ATG2P53855 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-2.65□□□□□ -2.83
ATG2P53855 snR74snR74 88 nt-2.66□□□□□ -2.84
ATG2P53855 YDR366CYDR366C 399 nt-2.68□□□□□ -2.84
ATG2P53855 CWC23YGL128C 852 nt-2.68□□□□□ -2.84
ATG2P53855 CBS1YDL069C 690 nt-2.7□□□□□ -2.84
ATG2P53855 SRB7YDR308C 423 nt-2.7□□□□□ -2.84
ATG2P53855 YKL202WYKL202W 582 nt-2.7□□□□□ -2.84
ATG2P53855 YGL052WYGL052W 306 nt-2.71□□□□□ -2.84
ATG2P53855 VPS63YLR261C 327 nt-2.71□□□□□ -2.84
ATG2P53855 MND1YGL183C 660 nt-2.73□□□□□ -2.85
ATG2P53855 YOL106WYOL106W 354 nt-2.77□□□□□ -2.85
ATG2P53855 Q0142Q0142 177 nt-2.78□□□□□ -2.85
ATG2P53855 snR51snR51 107 nt-2.79□□□□□ -2.86
ATG2P53855 LSM4YER112W 564 nt-2.8□□□□□ -2.86
ATG2P53855 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-2.8□□□□□ -2.86
ATG2P53855 snR81snR81 201 nt-2.81□□□□□ -2.86
ATG2P53855 SDH6YDR379C-A 240 nt-2.81□□□□□ -2.86
ATG2P53855 POP7YBR167C 423 nt-2.81□□□□□ -2.86
ATG2P53855 AIM29YKR074W 468 nt-2.82□□□□□ -2.86
ATG2P53855 VPS20YMR077C 666 nt-2.82□□□□□ -2.86
ATG2P53855 YER053C-AYER053C-A 114 nt-2.83□□□□□ -2.86
ATG2P53855 YER188C-AYER188C-A 300 nt-2.83□□□□□ -2.86
ATG2P53855 YNL058CYNL058C 951 nt-2.83□□□□□ -2.86
ATG2P53855 YPT6YLR262C 648 nt-2.84□□□□□ -2.86
ATG2P53855 snR59snR59 78 nt-2.85□□□□□ -2.87
ATG2P53855 YGL239CYGL239C 315 nt-2.86□□□□□ -2.87
ATG2P53855 YHR125WYHR125W 306 nt-2.87□□□□□ -2.87
ATG2P53855 HUR1YGL168W 333 nt-2.88□□□□□ -2.87
ATG2P53855 ACF4YJR083C 930 nt-2.88□□□□□ -2.87
ATG2P53855 ZEO1YOL109W 342 nt-2.89□□□□□ -2.87
ATG2P53855 YPL229WYPL229W 621 nt-2.89□□□□□ -2.87
ATG2P53855 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-2.9□□□□□ -2.87
ATG2P53855 MATALPHA2YCR039C 633 nt-2.9□□□□□ -2.87
ATG2P53855 HMRA2YCR096C 360 nt-2.9□□□□□ -2.87
ATG2P53855 JLP2YMR132C 627 nt-2.9□□□□□ -2.87
ATG2P53855 RDS3YPR094W 324 nt-2.9□□□□□ -2.87
ATG2P53855 FYV7YLR068W 456 nt-2.93□□□□□ -2.88
ATG2P53855 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-2.94□□□□□ -2.88
ATG2P53855 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-2.94□□□□□ -2.88
ATG2P53855 YGR025WYGR025W 303 nt-2.95□□□□□ -2.88
ATG2P53855 YOR364WYOR364W 369 nt-2.98□□□□□ -2.89
ATG2P53855 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-3□□□□□ -2.89
ATG2P53855 snR77snR77 88 nt-3□□□□□ -2.89
ATG2P53855 ILM1YJR118C 612 nt-3□□□□□ -2.89
ATG2P53855 YOR121CYOR121C 306 nt-3□□□□□ -2.89
ATG2P53855 YBR285WYBR285W 435 nt-3□□□□□ -2.89
ATG2P53855 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-3.02□□□□□ -2.89
ATG2P53855 YAR029WYAR029W 225 nt-3.04□□□□□ -2.9
ATG2P53855 YJR087WYJR087W 351 nt-3.04□□□□□ -2.9
ATG2P53855 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-3.04□□□□□ -2.9
ATG2P53855 CSE2YNR010W 450 nt-3.05□□□□□ -2.9
ATG2P53855 EAF6YJR082C 342 nt-3.08□□□□□ -2.9
ATG2P53855 snR39BsnR39B 96 nt-3.08□□□□□ -2.9
ATG2P53855 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-3.09□□□□□ -2.9
ATG2P53855 YCR001WYCR001W 315 nt-3.1□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YKL044WYKL044W 321 nt-3.1□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YLR334CYLR334C 381 nt-3.1□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YGL230CYGL230C 444 nt-3.11□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YNL205CYNL205C 423 nt-3.12□□□□□ -2.91
ATG2P53855 YLR456WYLR456W 615 nt-3.12□□□□□ -2.91
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