Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A2P52657 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2A2P52657 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms