Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E1P51965 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms