Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP5P51878 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP5P51878 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASP5P51878 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASP5P51878 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASP5P51878 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP5P51878 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP5P51878 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP5P51878 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP5P51878 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP5P51878 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP5P51878 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP5P51878 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP5P51878 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP5P51878 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP5P51878 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms