Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCNKBP51801 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms