Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK8P49336 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK8P49336 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDK8P49336 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK8P49336 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms