Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NESP48681 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NESP48681 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NESP48681 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NESP48681 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NESP48681 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NESP48681 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NESP48681 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NESP48681 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NESP48681 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NESP48681 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NESP48681 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NESP48681 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NESP48681 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms