Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA2P42765 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms