Protein–RNA interactions for Protein: P38204

RRN10, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN10, yeastyeast

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN10P38204 ISD11YER048W-A 285 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN10P38204 ALG13YGL047W 609 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN10P38204 RPS27BYHR021C 249 nt0.96□□□□□ -2.26
RRN10P38204 MCM10YIL150C 1716 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN10P38204 BEM2YER155C 6504 nt0.95□□□□□ -2.26
RRN10P38204 YOR218CYOR218C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
RRN10P38204 CMC4YMR194C-B 222 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN10P38204 NOP9YJL010C 2001 nt0.93□□□□□ -2.26
RRN10P38204 CSE2YNR010W 450 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN10P38204 SGF11YPL047W 300 nt0.92□□□□□ -2.26
RRN10P38204 DOP1YDR141C 5097 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN10P38204 STF2YGR008C 255 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN10P38204 YNL211CYNL211C 261 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN10P38204 YOR282WYOR282W 321 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN10P38204 YPL044CYPL044C 549 nt0.91□□□□□ -2.26
RRN10P38204 PAA1YDR071C 576 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YDL073WYDL073W 2955 nt0.9□□□□□ -2.27
RRN10P38204 HUG1YML058W-A 207 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YNL028WYNL028W 318 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN10P38204 IES4YOR189W 351 nt0.89□□□□□ -2.27
RRN10P38204 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN10P38204 BFR2YDR299W 1605 nt0.88□□□□□ -2.27
RRN10P38204 PMP1YCR024C-A 123 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN10P38204 ASE1YOR058C 2658 nt0.87□□□□□ -2.27
RRN10P38204 RAD61YDR014W 1944 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN10P38204 PAM16YJL104W 450 nt0.86□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YNL146WYNL146W 303 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN10P38204 PAU24YBR301W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN10P38204 RPL26BYGR034W 384 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN10P38204 YOR015WYOR015W 360 nt0.84□□□□□ -2.27
RRN10P38204 PRP16YKR086W 3216 nt0.84□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.83□□□□□ -2.28
RRN10P38204 RKR1YMR247C 4689 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN10P38204 snR65snR65 100 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.82□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YGR069WYGR069W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.8□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YPR117WYPR117W 7470 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.79□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.78□□□□□ -2.28
RRN10P38204 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YGL052WYGL052W 306 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YPR092WYPR092W 306 nt0.77□□□□□ -2.29
RRN10P38204 SEC8YPR055W 3198 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN10P38204 NPR2YEL062W 1848 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN10P38204 RPS30BYOR182C 192 nt0.76□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.75□□□□□ -2.29
RRN10P38204 CHS6YJL099W 2241 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN10P38204 snR190snR190 190 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.74□□□□□ -2.29
RRN10P38204 UBP3YER151C 2739 nt0.73□□□□□ -2.29
RRN10P38204 snR74snR74 88 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN10P38204 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN10P38204 SEC1YDR164C 2175 nt0.72□□□□□ -2.29
RRN10P38204 HAL9YOL089C 3093 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN10P38204 FYV10YIL097W 1551 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YLR282CYLR282C 342 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN10P38204 COY1YKL179C 2040 nt0.7□□□□□ -2.3
RRN10P38204 BUD3YCL014W 4911 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YML002WYML002W 2214 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN10P38204 PRP5YBR237W 2550 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN10P38204 COX5BYIL111W 456 nt0.69□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.67□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.66□□□□□ -2.3
RRN10P38204 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.65□□□□□ -2.31
RRN10P38204 OST4YDL232W 111 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN10P38204 ULI1YFR026C 510 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN10P38204 BLI1YKL061W 342 nt0.64□□□□□ -2.31
RRN10P38204 LTE1YAL024C 4308 nt0.63□□□□□ -2.31
RRN10P38204 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.63□□□□□ -2.31
RRN10P38204 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.63□□□□□ -2.31
RRN10P38204 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.63□□□□□ -2.31
RRN10P38204 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.63□□□□□ -2.31
RRN10P38204 snR49snR49 165 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.3 ms