Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms