Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT2P35908 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT2P35908 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT2P35908 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT2P35908 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT2P35908 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms