Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT3P35638 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms