Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXA10P31260 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms